
Благодаря рассказам родного дедушки, детство Джейкоба прошло совершенно необычно. Каждый вечер дедушка делился с любознательным внуком невероятными событиями, которые трудно было принять в качестве реально существовавших событий, ведь в них то и дело появлялись разные монстры и дети, обладающие сверхъестественными способностями. Большинство историй, рассказанных стариком, разворачивалось, как правило, на одиноком уединённом островке, где и расположен дом странных детей Мисс Перегрин. Как говорил дедушка, именно в этом доме ему и довелось расти. В юном возрасте главный герой вполне воспринимал рассказы своего деда, но с возрастом он уже начал сомневаться, что существует некий чудо-остров, невидимый глазу обычных жителей планеты.
Вскоре Джейкобу удалось познакомиться с очаровательной девицей Эммой, которая пригласила его в морское плавание, обещая поведать ему об удивительной находке в сердце моря. Сказать одно можно с уверенностью – девушка ничуть не обманула своего друга, когда он нырнул в её компании под воду, он был шокирован. Сначала они оказались у давно потопленного корабля, из которого Эмма смогла запросто удалить всю воду.
Вскоре, взяв обещание с Джейкоба никому не рассказывать об их путешествии, девушка перенесла его именно на тот остров, о котором парню всё время рассказывал его дедушка! Здесь он увидит разных детей: от невидимого ребёнка до девочки, у которой на затылке располагается зубастая пасть. Почему Джейкоб оказался здесь и в чём же его миссия?